Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms