Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VWDEQ8N2E2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms