Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TXNDC2Q86VQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNDC2Q86VQ3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms