Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP2Q86UW6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP2Q86UW6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms