Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms