Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRX1Q86UT6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms