Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC4Q7Z404 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms