Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9AQ7Z3C6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms