Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms