Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q71RC1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q71RC1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms