Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAXIP1Q6ZW49 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms