Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms