Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms