Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms