Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms