Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BLOC1S2Q6QNY1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S2Q6QNY1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms