Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms