Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6P435 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6P435 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6P435 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6P435 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6P435 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms