Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms