Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms