Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF20Q5VTR2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms