Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms