Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms