Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBAP2Q5T6F2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBAP2Q5T6F2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms