Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H13Q5T200 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H13Q5T200 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms