Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIVEP3Q5T1R4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms