Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms