Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF3Q5SZQ8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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