Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRMS1LQ5PSV4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms