Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms