Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDCCQ504Y2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms