Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms