Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms