Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms