Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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