Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms