Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms