Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms