Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q1T7F1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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