Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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GEN1Q17RS7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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GEN1Q17RS7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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GEN1Q17RS7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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GEN1Q17RS7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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