Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms