Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCK2Q16822 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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