Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms