Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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