Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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RPE65Q16518 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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RPE65Q16518 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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RPE65Q16518 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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