Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRK1Q15835 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms