Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITSN1Q15811 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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