Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP10Q15642 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms