Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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