Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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